高度推荐以下用户使用该试剂盒:
- 希望移除逆转录或PCR 带来的偏好性误差
- 转录本难以进行逆转录
- 正在探索天然RNA的属性,如修饰碱基
直接RNA测序试剂盒详情:
特征 | 性质 |
制备时间 | 115分钟 |
起始样本要求 | 500 ng RNA(polyA ) |
需要进行逆转录 | 可选 |
是否需要PCR | 否 |
读长 | 等于RNA长度 |
产生读长类型 | 1D |
典型通量* | ... |
典型读长数量 | 100万条全长读长 |
相关实验方案 | 直接RNA测序 (Direct RNA Sequencing) 序列特异性直接RNA测序(Sequence-specific direct RNA sequencing) |
混样建库测序可选产品 | 条码试剂盒(Barcoding kits)正在开发中 芯片清洗试剂盒 (Flow Cell Wash Kit) |
包装规格 | 6个反应 |
稳定性 | 运输温度:2–8°C 长期储存温度:-20°C |
兼容性 | 测序芯片: FLO-MIN106 FLO-MIN107 |
说明
直接RNA测序试剂盒(SQK-RNA002)可用于制备任意带3´ polyA 尾的RNA,并在Oxford Nanopore测序装置上进行1D测序。可使用的RNA包括真核mRNA,带polyA 尾的病毒RNA,或使用polyA 加尾试剂盒制备的任意RNA。对于没有polyA 尾的RNA,用户可以按照 简单的指示操作来设计自定义接头,以连接特定的3´ 端序列 (如3´ tRNA或16S rRNA)。该试剂盒RNA 起始样本量要求为500ng。
与通过使用RNA为模板得到cDNA,并对其进行测序的cDNA测序实验方案不同,直接RNA测序试剂盒制备的是用于测序的RNA本身。在直接RNA测序中,只有天然RNA穿过纳米孔传感器,因此读长长度反映的是样本中RNA分子的长度。
直接RNA测序方案包含一个可选的(建议使用)逆转录步骤。尽管在该步骤中产生的cDNA链不被用作测序,但该步骤能够显著提高测序通量。
进一步考虑:
直接RNA测序试剂盒是一个新推出的试剂盒,它的准确度和通量将会随后续推出的试剂盒版本不断提高。对于不需要利用直接RNA测序关键优势(检测修饰碱基和降低偏好性)的应用,用户可以考虑使用Oxford Nanopore的cDNA试剂盒,目前它可提供的单次运行通量为最高。
Oxford Nanopore technologies公司视该产品的使用寿命为自客户收到产品之日起的3个月。
使用直接RNA测序试剂盒试剂盒的实验方案样本 - 仅用于示范
直接RNA测序试剂盒包含充足的试剂,足以构建6个测序文库
RTA:逆转录接头(RT adapter) | WSB:清洗缓冲液(Wash buffer) |
RMX: RNA 接头试剂(RNA adapter mix) | ELB:洗脱缓冲液(Elution buffer) |
RCS:RNA标准链(RNA callibration strand) | RRB:RNA运行缓冲液(RNA running buffer) |
FLB: 冲洗缓冲液(Flush Buffer)
FLT: 冲洗细绳 (Flush Tether)